指揮中心3日表示，據調查，中國返台的旅客有2成經香港、澳門轉機，因此宣布1月6日起至31日，自中國經港澳轉機入境台灣的旅客須持有啟程地搭機前48小時內PCR或24小時內抗原快篩檢驗報告。

總統蔡英文1月1日上午在總統府發表新年談話，蔡英文表示在新冠病毒疫情、俄烏戰爭爆發、中國對台軍演等種種考驗，感謝國人各司其職、一同穩健走過2022年，而2023年全球經濟預期持續轉弱、加上能源與糧食的不穩定性，各國將面臨更嚴峻的挑戰，昨天國安高層會議提出減輕人民負擔、穩定民生物價、調整產業體質、維持經濟動能等4大目標來因應局勢變化，未來一年執政團隊將以照顧人民生活、維持經濟動能、守護國家安全、善盡區域責任等為首要任務，盼大家如今年元旦主題一樣"眾志成城、台灣向前"；另在兩岸議題上，蔡英文重申戰爭不是解決問題的選項，對話、合作才能促進區域和平穩定，對中國疫情升溫，蔡英文表示基於人道關懷立場、願意提供必要協助。

中國國家主席習近平31日發表2023年新年賀詞，其中提到疫情防控來到新階段，呼籲大家再加把勁、曙光就在前方，並讚揚香港落實一國兩制"由治及興"；關於台灣的部分，習近平說海峽兩岸一家親，表示"衷心希望兩岸同胞相向而行、攜手並進，共創中華民族綿長福祉"。

媒體報導，近期2個中國抵達米蘭(Milan)的航班中有近半數的乘客採檢陽性，因此義大利衛生部長28日表示，義大利將針對所有自中國入境的人士進行強制性採檢。

因應中國疫情升溫，指揮中心28日宣布，明年1月1日至1月31日，除持續禁止中國觀光客來台政策外，自中國4個直航航線與金馬地區民眾春節交通專案的來台旅客，入境均需配合唾液PCR採檢、後續返回住處進行7天自主防疫與自我篩檢，篩檢陽性者依規定進行5+n居家照護與自主健康管理、檢體將送往實驗室進行病毒基因定序。

行政院首席防疫顧問、台大副校長張上淳22日接受媒體訪問時表示，儘管官方數據很低，但從其他面向與報導可以了解到中國疫情正在大量傳播，其中須注意有無新變種病毒出現、以及致病、致死率如何，認為國內可針對自中國返台確診的民眾做病毒基因定序進行監測，對台灣來說，若病毒株沒有太大變化、影響就不大。

中國防疫政策自動態清零急轉彎大幅放寬限制，近期染疫人數遽增造成民眾爭搶購買感冒類藥品，以及至澳門接種BNT疫苗的遊客增加，與此同時殯喪服務需求也處於激增狀態；中國網友感嘆人如螻蟻命如草芥，另批評政府盲目開放造成悲劇。

隨著防疫鬆綁，中國多地疫情迅速爆發，各醫院已要求醫護人員帶病上班，在此情形下，四川大學華西臨床醫學院一名23歲陳姓學生疑因染疫後發燒仍持續上班、最後昏迷不治；對此，華西醫院否認染疫帶病上班的說法，並表示該生正在加護病房搶救，15日凌晨院方通報陳姓學生心源性猝死，其死因與搶救處置遭到網友質疑。

中央流行疫情指揮中心14日公布，新增本土16578例、境外移入41例，有中重症66例；死亡個案增40例，年齡在40歲至90歲以上；另外最新的病毒基因定序結果，檢出本土第2例感染BQ.1變異株的個案，為本國籍20多歲男性，5月下旬曾確診，10月底因發燒、腹瀉就醫，PCR確診、疑重複感染。

中央流行疫情指揮中心14日公布，新增本土17549例、境外移入114例，中重症109例；死亡個案增37例，年齡在20歲至90歲以上，最年輕的個案為20多歲男性，本身有血液疾病、接種過1劑疫苗。